上海药物所合作举办2023上海国际计算生物学创新大赛
文章来源:上海药物研究所 | 发布时间:2024-09-30 | 【打印】 【关闭】
2024年9月9日,2023(首届)上海国际计算生物学创新大赛——药物筛选AI算法“凌越”挑战赛在2024浦江创新论坛(上海国际计算生物学创新专题论坛)上宣布收官并举行颁奖仪式。本次大赛贯彻国家、上海市和中国科学院融合人工智能(AI)推动生物医药发展的战略部署,在上海市科学技术委员会指导下,由上海市生物医药科技发展中心联合上海药物所、中国银行上海市分行和华为云等单位共同举办。
“凌越”寓意“飞凌超越”,是药物所原创新药研究全国重点实验室的项目品牌。药物所原创新药研究全国重点实验室作为本次大赛的出题方,聚焦人工智能在离子通道药物研发中的应用,以NMDA(N-methyl-D-aspartate,N-甲基-D-天冬氨酸)受体为靶标进行药物虚拟筛选。NMDA受体是在中枢神经中广泛分布的一类兴奋性受体,调控神经发育、学习和记忆等生理功能,是一类重要的蛋白靶标。NMDA受体与多种疾病相关,如脑卒中、抑郁症、癫痫、AD等,是神经系统性疾病最热门的药物开发靶点之一,靶向NMDA受体的药物开发具有重要的临床意义和市场价值。NMDA受体家族包含多个亚基,功能性的NMDA受体是由不同亚基形成的异源四聚体,因此亚基多样性决定了NMDA受体的亚型多样性。本次大赛重点关注的GluN1/GluN3A是NMDA受体亚型之一,目前还未作为靶点广泛开发。特异性小分子调节剂以及晶体结构信息的匮乏,极大地限制了该靶点的进一步研究。本次大赛基于NMDA受体家族已知的蛋白序列、结构及活性分子信息,通过AI算法发现潜在的特异性作用于GluN1/GluN3A亚型的高活性分子,进而在评选过程中引入湿实验验证。药物所离子通道平台承担本次大赛“湿实验”验证工作,采用离子通道研究领域广泛认可的药物发现与评价方案,通过实验验证AI技术筛选出的潜在高活性分子的特异性和有效性。这一创新性方式深度融合了AI技术和传统药物研发的过程,实现在真实场景中验证和优化算法的同时增加算法和潜力分子的落地价值,有效提升评选的科学严谨性和实用价值。
自2023年12月15日赛事公布之日起,大赛吸引了逾1300名专业人才参加,组建了超过330支竞赛团队。经过多轮评审,一批尖端算法和具有潜力的高活性分子在大赛中脱颖而出。决赛现场,5支团队进行“巅峰对决”。最终,本次大赛结合湿实验得分(占70%)、决赛现场汇报答辩、建模探索过程、建模方案创新性等维度的综合打分,评选出一等奖1名、二等奖2名、三等奖2名。药物所陈凯先院士、李佳所长、原创新药研究全国重点实验室高召兵主任等嘉宾分别为获奖团队颁奖。
原创新药研究全国重点实验室高召兵主任受邀做报告
陈凯先院士等为一等奖获奖团队颁奖
药物所所长李佳、原创新药研究全国重点实验室主任高召兵等为二等奖获奖团队颁奖