众所周知，抗生素抗性基因（ARGs）是一种全球污染物，对公众健康构成潜在风险。到目前为止，关于ARGs的研究多集中在废水、污泥和粪肥上。通过废水灌溉和施用有机肥，ARGs会扩散到农业土壤中，进而转移到更广泛的环境和作物中。
土壤动物在土壤功能和生态过程中发挥着关键作用，其肠道中栖息着大量微生物。多项研究表明，土壤动物肠道微生物可以富集ARGs，成为ARGs的潜在储存库。据报道家蝇肠道菌群对猪粪中ARGs有消减的作用。那么，ARGs在不同土壤动物肠道微生物中的命运又如何呢？
鉴于此，中国科学院城市环境研究所城市与健康重点实验室朱永官研究组通过一个长期施肥的农田监测点，探讨了不同施肥时间和施肥方式对于土壤微生物、线虫和蚯蚓肠道微生物中ARGs的影响。研究结果表明，ARGs在线虫和蚯蚓肠道微生物中的命运不同，前者较后者有更高的富集水平；施肥方式显著影响了土壤中ARGs的数量和丰度，施肥时间则明显改变了ARGs的组成；我们进一步通过微生物溯源分析和共享ARGs数据构建了ARGs在土壤-线虫-蚯蚓中的迁移网络；而ARGs随着时间而消减的原因则主要归功于蚯蚓肠道微生物中ARGs的减少。这些发现提供了ARGs在土壤生态系统中广泛传播的潜在迁移机制，并强调了土壤动物可能在ARGs的消减中起着重要作用。
相关成果以“Fates of Antibiotic Resistance Genes in the Gut Microbiome from Different Soil Fauna under Long-Term Fertilization”为题，发表于国际期刊Environmental Science & Technology上，博士生郑飞与毕庆芳为论文共同第一作者，杨小茹研究员为论文通讯作者。该研究获得国家重点研发计划项目（2017YFE0107300），国家自然科学基金项目（41977201和41571130063）以及王宽诚教育基金的资助。
抗生素抗性基因在土壤动物肠道中的迁移示意图
